El equipo de trabajo
Mauricio Hernández Espinal
Biólogo egresado de la Universidad Nacional Autónoma de Honduras. Realizó la maestría en Geología aplicada en la Universidad de Zaragoza, España. Actualmente es estudiante de doctorado en el CTBC de la Universidad Autónoma de Tlaxcala.
El biólogo de campo del grupo
Estudiante de doctorado
Actualmente, mi investigación se enfoca en comprender como diferentes factores ecológicos, e.g. dieta, estacionalidad y ambiente físico, estructuran las comunidades microbianas en diferentes especies de lagartijas del género Sceloporus que habitan en un ecosistema de alta montaña. Además, tratamos de dilucidar qué métodos no letales, e.g. muestras fecales e hisopos cloacales, son más precisos para el estudio de la microbiota que está presente a lo largo del tracto digestivo, usando como modelo de estudio a la lagartija del mezquite, Sceloporus grammicus. A través de herramientas moleculares y análisis matemáticos robustos evaluamos la importancia de las comunidades microbianas intestinales en los procesos ecológicos y adaptativos de los organismos en vida libre.
Galería de las salidas de campo
Estas son las imágenes de algunos especímenes que hemos capturado, y algunas otras de los magestuosos paisajes que tengo la fortuna de apreciar durante mi trabajo de campo. ¡Sí que soy afortunado!
Stephanie Hereira Pacheco, PhD
Ingeniera Agroindustrial egresada de la Universidad del Atlántico de Colombia. Realizó la maestría y Doctorado en el área de Biotecnología en el Cinvestav, IPN. Actualmente es posdoctorante en el CTBC de la Universidad Autónoma de Tlaxcala.
Curso básico de R
Soy una apasionada por el análisis y visualización de datos en el software R. Elaboro mis propios scripts los cuales comparto y son de acceso libre en mi página personal.
Curso básico de R
También me da mucha satisfacción compartir mis conocimientos de R a través de cursos y clases impartidas en el posgrado en Ciencias Biológicas del CTBC, UATx.
R para análisis ecológicos
Tengo mi canal en Youtube donde puedes seguir mis diversos cursos y clases.
La bioinformática del grupo
Estancia Posdoctoral
Los microorganismos son de gran importancia en muchos aspectos de la vida. Hoy en día, la ciencia moderna está reconociendo la importancia del microbioma en diversos organismos, los cuales tienen un rol importante en diversas funciones del hospedero, además de su resiliencia a condiciones ambientales adversas. Esto se ha observado en humanos, organismos modelo, animales silvestres, plantas y en diversos ecosistemas y/o hábitats.
¿Qué hago?
Soy una científica enfocada principalmente en el análisis bioinformático y estadístico de datos de microbioma provenientes de “metabarcoding” y “shotgun”. Tengo experiencia con diversos sistemas de estudio, e.g. plantas (ricino), animales (lagartijas) y muestras ambientales (suelos).
¿Dónde me formé?
Realicé mis posgrados en el Cinvestav, IPN como investigadora en biología molecular y actualmente me especializo en Ecología microbiana.
¿Qué hago actualmente?
Mi investigación actual se enfoca en determinar los factores ambientales y ecológicos que definen la diversidad taxonómica y funcional de las comunidades fúngicas de suelos forestales mediante análisis metagenómicos y de “metabarcoding”. Nuestros sitios de muestreo se localizan en los Parques Nacionales “Iztaccíhuatl–Popocatépetl” (PNIP) y “La Malinche” (PNLM) en el estado de Tlaxcala.
También colaboro con YenLab en el análisis y estudio de varios proyectos relacionados con el microbioma de lagartijas del género Scelopurus, dilucidando como diferentes factores ecológicos estructuran las comunidades bacterianas en estas especies hospederas. Además, colaboro con otros proyectos relacionados con el uso de cambio de suelo y las ventajas de mantener una agricultura sustentable.
Nina Montoya Ciriaco
Microbióloga egresada del Instituto Politécnico Nacional. Realizó la Maestría en Ciencias Químicobiológicas en la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, IPN. Actualmente es estudiante de doctorado en el CTBC de la Universidad Autónoma de Tlaxcala
La bióloga molecular del grupo
Estudiante de doctorado
Mis intereses de investigación incluyen la interacción huésped-microbiota, la Ecología microbiana, la Biología molecular y la Bioinformática. Específicamente, estoy interesada en estudiar el microbioma y comprender los factores extrínsecos e intrínsecos que estructuran la microbiota gastrointestinal de animales silvestres.
Actualmente, mi investigación en YenLab se enfoca en demostrar la transferencia vertical de microbiota de madres a su descendencia usando como modelo de estudio a la lagartija del mezquite Sceloporus grammicus. Además, investigamos el microbioma reproductivo en esta especie. La microbiota gastrointestinal juega un papel importante durante la gestación y posiblemente le ha permitido sobrevivir en condicionees ambientes hostiles como la cima de la montaña La Malinche.
Sobre mi formación anterior
Durante la maestría investigué el efecto de un gradiente altitudinal sobre el microbioma de S. grammicus en el Parque Nacional La Malinche. Adicionalmente, durante la licenciatura y maestría realicé una estancia de investigación en Ecologia microbiana en el laboratorio de Ecología molecular de suelos en el Cinvestav, IPN, en donde adquirí experiencia en biología molecular y colaboré en diversos proyectos de investigación.
¡Además, soy microbióloga!
Soy Químico Bacteriólogo y Parasitólogo, egresada de la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del Instituto Politécnico Nacional. Me encanta el mundo microscópico y me siguen asombrando todas las funciones que los microorganismos realizan en todos los sistemas de nuestro planeta. Hoy día, sigo trabajando en el análisis bioinformático de datos de “metabarcoding” y quiero especializarme en el análisis de datos “shotgun”.
Selene Gómez
Doctora en Ciencias con especialidad en Biotecnología
Químico Bacteriólogo Parasitólogo de la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas (ENCB) del IPN, realicé una maestría en Ciencias Quimicobiológicas en la ENCB y un doctorado en el Cinvestav, IPN. He colaborado como investigadora postdoctoral en el Tecnológico Nacional de México en Guanajuato, en el Instituto de Ecología e Instituto de Ciencias de la Atmósfera y Cambio Climático de la UNAM.
Actualmente colaboro en YenLab como investigadora posdoctoral estudiando la transferencia del microbioma durante la gestación de lagartijas del género Sceloporus por medio de herramientas bioinformáticas para el análisis de secuencias “shotgun”, con esto se busca comprender no solo que microorganismos se transfieren sino también qué funciones metabólicas son compartidas en esta etapa.
Lo que no vemos en una placa petri
He trabajado en proyectos de microbioma desde hace 10 años, comencé estudiando las comunidades bacterianas en suelos durante el doctorado para posteriormente investigar aquellas que se encuentran en otros modelos de estudio como biorreactores, animales, microbialitas y bioaerosoles, gracias a esto he logrado comprender más profundamente que la vida en este planeta no sería posible si no existieran los microorganismos.
¿Y qué pasa con los cultivos microbiológicos?
Como microbióloga me sigue emocionando el estudio de las bacterias a través de métodos dependientes de cultivo, por lo que he trabajado aislando bacterias simbiontes fijadoras de nitrógeno, las llamadas “rizobios” a partir de nódulos de plantas de huizache, así como con hongos formadores de micorriza arbuscular, aquellos que ayudaron a que las plantas poblaran la Tierra, y si bien no tengo fascinación por los deportes extremos por las bacterias extremófilas sí, en particular aquellas amantes de la sal, las conocidas halófilas que estudié del cráter del Rincón de Parangueo.
Compartiendo la pasión por lo diminuto
Me emociona hablar de los microbios y compartirlo con personas amantes y curiosas de la vida microscópica, así fundé colectivo microbia y diario de una bacteria, espacios en redes sociales para hablar de las singularidades que esconde el universo de lo invisible a primera vista ¿Te gustaría conocer a los microbios a través del cine? ¿Sabes qué pasa con las bacterias en nuestro cuerpo después de la muerte? ¿Te imaginas lo que contarían las bacterias si pudieran hablar? Te invito a averiguarlo a través de los videos que encuentras en mis redes sociales.
Braulio Perez Alva
Estudiante de doctorado
Mi área de interés y en la que me he desempeñado, se centra en el estudio de poblaciones y comunidades en el ámbito de la ecología y la genética, en particular con las plantas, incluyendo orquídeas, plantas carnívoras y pinos.
Actualmente, en YenLab, mi investigación se enfoca en comprender el impacto de los factores ambientales en las turberas (un tipo de humedal) sobre la diversidad y funcionalidad de bacterias y arqueas. Además, me interesa explorar cómo se define el nicho metabólico de estos microorganismos en dicho hábitat.
Sobre mi formación anterior
Durante la maestría, mi investigación se enfocó en la diferenciación genética de las poblaciones de ocote chino (Pinus leiophylla) en Tlaxcala. En la licenciatura, desarrollé dos investigaciones. El primero abordó el impacto de los factores ambientales en los caracteres morfológicos y reproductivos de la planta carnívora "violeta de barranca" (Pinguicula moranensis), que ha experimentado una disminución en sus poblaciones en Tlaxcala. El segundo proyecto se enfocó en describir una población previamente no registrada de la orquídea "azucena de monte" (Govenia purpusii) en La Malinche.
A lo largo de mi trayectoria académica, he adquirido una variedad de herramientas y técnicas que han sido fundamentales en mis investigaciones. Entre estas habilidades destacan el manejo de Sistemas de Información Geográfica, Bioinformática, Diseño Gráfico y el Cultivo de Tejidos Vegetales. Estas competencias han enriquecido mi capacidad para abordar diferentes aspectos de mis estudios y han sido cruciales para mi desarrollo profesional.
Construyó y diseñó: Yendi Navarro Noya. Mantenimiento: Selene Gomez y Yendi Navarro
Conociendo nuestro ambiente a la luz de los microorganismos
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